最新免疫学研究表明：IBS和IBD的发病除了遗传因素之外，均是由于肠道菌群长期失调，特别是产酪酸菌不足引起的肠免疫功能和肠神经功能紊乱造成的。具体表现为在肠菌群失调的情况下，产酪酸等短链脂肪酸的益生菌不足，而有害菌比例升高，有害菌产生的毒素及脂多糖等对黏膜上皮细胞形成了攻击，肠上皮细胞受到攻击后首先分泌趋化因子IL-8等，指引中性粒细胞，巨噬细胞集中到炎症部位，由黏膜上皮细胞同时分泌的核转录因子NF-KB也进入了各活化细胞的核中引发级联反应，致使TNF-α、IFN-γ、IL-1β、IL-6、IL-8等炎症因子异常过度表达。这种异常转录表达的最初目的是机体为了消除炎症因素，但当肠道内产酪酸益生菌不足时，这种过度表达就不能得到有效控制，造成炎症持续严重发展，中性粒细胞、巨噬细胞和肥大细胞产生的金属基质蛋白酶MMP-1、2、3和生物氧化剂（H₂O₂ 、OH^-）就会溶解损伤肠黏膜，增加黏膜通透性，造成上皮细胞炎症和溃疡。如果肠黏膜在受到攻击时，肠道内有足够多的产酪酸益生菌，这些致炎症因子的异常表达将很快得到有效控制，而恢复正常。所以IBS和IBD成为久治不愈的难治性疾病的病理基础都是肠道内没有足够的产酪酸益生菌导致的。

　　因此，对IBS、IBD的科学治疗，均应从迅速补充肠道产酪酸菌入手。

　　在临床治疗上，若一时购买不到产酪酸的酪酸梭菌制剂，也可选用一些能产乳酸、乙酸的益生菌制剂，但效果要差些。因为乳酸、乙酸等必须转化为酪酸（丁酸）才能发挥最好的治疗效果。